Limitações da PubMed

Limitações

A ferramenta de busca da PubMed não lida com múltiplos termos de forma eficaz. A recuperação bem-sucedida de artigos depende dos autores declararem claramente todos os termos necessários no título, palavras-chave, resumo e corpo do texto do artigo. É importante observar que uma busca sem restrições na PubMed também analisa a seção de referências, o que pode levar a muitos FP. Logo, temos que restringir as buscas ao título e abstract ([Title/Abstract]) para contornar esse problema, possivelmente gerando vários FN.

Além disso, LLMs e PubMed também podem produzir FNs se os artigos não forem de livre acesso ou estiverem ocultos na documentação da patente.

Aviso

Em qualquer pesquisa temos o comprometimento entre filtrar muito ou filtrar pouco ao fazermos uma pergunta (query). Para medirmos este fenômeno precisamos calcular a Sensibilidade e Especificidade, ou seja conhecer os FP e FN, tarefa que neste tipo de pesquisa pode ser muito difícil.

Exemplo errado

hipertension AND systemic AND cardio AND (CVA OR cerebrovascular accident) AND deaths

Motivo

  1. muitos termos podem levar a muitos FN

  2. use radicais seguidos de asterisco: card*

  3. use ao máximo palavras sinônimas concatenadas com OR: cerebr* OR brain*

  4. pesquise cada conceito e utilize a numeração das pesquisas: #1 AND #2 AND (#3 OR #4 OR #5)

  5. não use plural

  6. tente usar termos MESH, vá escrevendo o que deseja na tela inicial da PubMed que ela vai autocompletando possíveis termos controlados.

Importante

As primeiras pesquisas nunca são boas.
Nunca acredite que 2 ou 3 pesquisas são boas e suficientes, sem análise mais profundas.

Dicas de como pesquisar

  • Construa uma pesquisa (query) na PubMed

  • Utilize, quando possível, o mínimo número de termos

  • Sempre que possível filtre por [Title/Abstract]

  • Analise as referências de retorno

  • Anote novos conceitos e palavras sinônimas ou homólogas

  • Refaça a pesquisa

  • Pesquise com IA: anote novos conceitos e palavras sinônimas ou homólogas

  • Refaça a pesquisa: inclua novos conceitos e sinônimos usando OR

  • Estude a melhoria de cada passo / resultados

  • Estude se há FP: artigos trazidos errados (se sim, refaça a pesquisa usando cláusula NOT)

  • Se você não é um especialista na área é praticamente impossível analisar FN (referências que deveriam ter aparecido)

  • Sempre que possível peça ajuda a pessoas mais experientes na área

  • Nunca ache que sua pesquisa terminou e está ótima: sempre há algo para melhorar

  • Nunca diga boa sorte! Sorte é acaso. Estude, estude muito: bom trabalho